ホームページビルダーのナゾの仕様・・・？

お客様のサイトで、CGIが使用できなくなっているとのお問い合わせ・・・。
エラーメッセージを見ると、どうも、CGIのパーミッションの設定ミスっぽい。
で、何かの拍子に、パーミッションが変わっちゃうこともあるかもしれないなあーとおもいつつ解決策を探っていたら・・・
もしかして、ホームページ･ビルダーが、なんか余計なことしてる？
と思い、ホームページビルダーでの、CGIの扱い、パーミッションの扱いをヘルプで検索してみたら・・・
衝撃の事実が
ビルダーでは、パーミッションのことを、アクセス権限というらしく、FTPツールというのを使うと、ビルダー上でアクセス権限の変更もできるみたい、なのですが。

再び同じファイルを転送すると、アクセス権が元に戻ってしまいます。
とかさらっとヘルプに書いてあるんですけど。
はい？なんですって？もう一回いってください。
アクセス権を設定しても、ファイルを再送すると、元に戻っちゃうってことですか？
どういうこと？
わたしの日本語の解釈が間違ってますか？
このとおりだと、ビルダーでCGIファイル転送するたびに、アクセス権限の再設定が必要で、何も考えないで再送すると、いちいちCGIが使えなくなるってことになるような気がするんですけど。
でも、そんなにホームページビルダーでCGIがいちいち使えなくなった！って困ってる話も聞かないし・・・。
基本的には、アクセス権はいじらない仕様になってるというような表現もみかけるし・・・
どーなってんだろー？
むかーし、Dreamweaverでも、パーミッションの変更はソフト内ではできなくて、できたら便利なのにと文句言いつつ、FTPはFTPでやるというクセがついていましたが・・・（いまではDreamveaver内でFTPとかパーミッション変更とかもできるハズ？ですが、使ってないです）。
うーむ、なぞです。

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